Alcune opere di Nilo Bacherini si trovano:
Collezione civica Comune di Grosseto
Collezione civica Amministrazione Provinciale di Grosseto Museo civico “8 Ruote” Finale Emilia – Modena Collezione civica Comune di Arezzo
Collezione civica Comune di Piombino (Li) Museo della Pace – Copenaghen
Museo del Manifesto Azzurro Boville Ernica – Frosinone Collezione civica Comune di Sorano
Museo Cateriniano arte contemporanea Chiesa di San Simeone – Castiglion d’Orcia (SI) Collezione pinacoteca di Marina Gioiosa Ionica – Reggio Calabria
Collezione pinacoteca Amedeo Modigliani – Follonica (GR)
Museo d’arte Generazioni Italiane del ‘900 sez.ne Maestri Italiani degli anni ‘20 Pieve di Cento – Bologna Collezione civica Regione Toscana Palazzo Vittori – Firenze
Collezione civica Civitella Val di Chiana – Arezzo Murale alle Pareti Dipinte Val di Non – Trento
Museo civico Comune di San Roberto – Reggio Calabria Collezione d’arte moderna e contemporanea “Il Sole” -Grosseto